น้ำตาลเพนโตส คือ น้ำตาลโมเลกุลเดี่ยวที่มีคาร์บอน 5 ตัว C5H10O5
แม้ว่าน้ำตาลเพนโตสทุกไอโซเมอร์จะมีสัดส่วนอะตอมที่เหมือนกัน แต่มีไอโซเมอร์จากตำแหน่งของพันธะคู่ของออกซิเจนและหมู่แอลกอฮอล์ที่ไม่สามารถสลับได้ง่ายที่อุณหภูมิห้อง
ไอโซเมอร์ของน้ำตาลเพนโตส มี 23+22+21 = 14 แบบ แบ่งเป็น อัลโดส(อัลดีไฮด์:พันธะคู่ของออกซิเจนอยู่ที่คาร์บอนตัวแรก) 8 แบบ, 2-คีโตส (คีโตน:พันธะคู่ของออกซิเจนอยู่ที่คาร์บอนตัวที่2) 4 แบบ, 3-คีโตส (คีโตน:พันธะคู่ของออกซิเจนอยู่ที่คาร์บอนตัวที่3) 2 แบบ
น้ำตาลเพนโตสในธรรมชาติส่วนใหญ่อยู่ในรูปของ D-ไรโบส และ D-ไรบูโลส
ไอโซเมอร์ของอัลโดส
| SRR | ![]() | D-อาราบิโนส | RSS | ![]() | L-อาราบิโนส |
| SSR | ![]() | D-ไลโซส | RRS | ![]() | L-ไลโซส |
| RRR | ![]() | D-ไรโบส | SSS | ![]() | L-ไรโบส |
| RSR | ![]() | D-ไซโลส | SRS | ![]() | L-ไซโลส |
ไอโซเมอร์ของคีโตส
| SR | ![]() | D-ไรบูโลส | RS | ![]() | L-ไรบูโลส |
| RR | ![]() | D-ไซลูโลส | SS | ![]() | L-ไซลูโลส |